In Half Life 2 geht der Kampf gegen Xen in die zweite Runde in einer Ost-Europäischen Stadt (City 17). Zudem gilt es eine Polizei Truppe, welche die Bürger kontrollieren will, zu bekämpfen: die Combine.  In Kanalsystemen und Hovercraft-Fahrzeugen geht es dem Gegner an den Kragen, später wird die Geisterstadt Ravenholm erobert, dann geht es nach Nova Prospekt, ein Zentrum der Combine um dann am Schluss  hinter das Geheimnis der Kontrolle der Xen Welt zu kommen: in der Zitadelle. Einige Kriegsschauplätze tun sich unterwegs noch auf: es gilt dreibeinige Panzer zu bekämpfen die wie Riesenspinnen auf Stelzen laufen: die Strider.  Zur Seite stehen Gordon Freeman die attraktive Alyx und deren Vater Dr. Eli Vance sowie das intelligente Xen Wesen, ein Vortigaunt. Auch Dr. Isaac Kleiner und Dr. Judith Mossman sind mit von der Partie.  Die Story wird in Half Life Episode One und Half Life Episode Two fortgeführt.  In Half Life Episode Two wird das Spiel um einige Xen-Artefakte erweitert und die Vortigaunts nehmen eine grössere Rolle ein.  Die ganze Half Life Serie gibt es in Boxen: Half Life 1 mit Team Fortress, Opposing Force und Blue Shift als Game of the Year Edition, Half Life 2 in der Orange Box mit Episode One, Episode Two, Portal und Team Fortress 2. 

Level in Half Life 2:
Endstation City 17, Ein denkwürdiger Tag, Kanal-Route, Wassergefahr, Ravenholm, Highway 17, Sandlöcher, Nova Prospekt, Verflechtung, Antibürger Eins, Folgt Freeman!, Unsere Wohltäter, Dunkle Energie. 

Black Mesa Source 
Eine freie und optisch verbesserte Modifikation von Half-Life ist Black Mesa Source. Diese Half Life Modifikation spielt im Half Life Universum wieder mit Gordon Freeman und wird frei verfügbar sein. Die einzige Voraussetzung ist,  das man über eine Half Life Source Engine (auf STEAM) verfügt. Die Liste der Spiele, die dies ermöglichen stehen auf der Entwickler Homepage von Black Mesa Source.